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L’avenir auquel le monde se trouvait destiné, est totalement différent de celui qui les attend désormais. Le futur aurait dû être dévasté par le projet Sentinelles de Bolivar Trask, mais un retour dans le temps a été de rigueur. Désespérés alors que leurs fins approchaient à grands pas, et afin de préserver les mutants, un léger voyage dans le passé fut accompli pour détruire ce projet à ses origines, changeant ainsi toute la chronologie qui suivra.

Ce fut lors de ces événements que mutants furent dévoilés aux yeux des humains. Magneto, et tout particulièrement Mystique passée héroïne aux yeux du peuple, bien que les X-Men n’aient été dévoilés et soient restés dans l’ombre, Xavier craignant pour son école de surdoués. Magneto est un mutant recherché par les autorités, mais l’héroïsme qu’ils considèrent chez Mystique redonne de l’espoir aux humains et, ainsi, en ces derniers moments, humains et mutants ne sont pas en conflit.

Quelque chose que chacun redoute tout particulièrement : une guerre humains contre mutants. Mutants qui ne cherchent qu’à se faire accepter parmi la société actuelle très peu ouverte d’esprit malgré le fait qu’ils soient des surdoués. Certains se rassemblent, d’autres continuent leur chemin en solitaire. Certains se retrouvent pris en charge par des entités telles que Charles Xavier ou bien même Erik Lehnsherr, l’un accentuant son école et l’autre en remplissant sa future armée, des mutants à la haine féroce contre les humains.

Il est définitivement clair que deux camps s’opposent, malgré l’amitié des deux célèbres mutants qui pourtant sont contre par leurs idéaux : l’un souhaite que tout le monde cohabite en paix tandis que l’autre serait prêt à déclarer la guerre. Pourtant, au vu de ce qui les guettent, il faudra bien que tous les mutants se réunissent pour lutter contre l’ennemi, afin de protéger soit toute la communauté mutante, ou bien tout simplement pour sauver le monde. Mais, et si leur ennemi était tout simplement .. Eux-mêmes ?